Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO1P25800 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO1P25800 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO1P25800 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO1P25800 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO1P25800 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO1P25800 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO1P25800 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO1P25800 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO1P25800 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO1P25800 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO1P25800 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO1P25800 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO1P25800 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO1P25800 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO1P25800 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO1P25800 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO1P25800 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO1P25800 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO1P25800 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO1P25800 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO1P25800 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO1P25800 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO1P25800 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO1P25800 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO1P25800 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO1P25800 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO1P25800 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO1P25800 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO1P25800 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO1P25800 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO1P25800 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO1P25800 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO1P25800 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO1P25800 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO1P25800 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO1P25800 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO1P25800 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO1P25800 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO1P25800 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO1P25800 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO1P25800 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO1P25800 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO1P25800 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO1P25800 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO1P25800 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO1P25800 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO1P25800 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO1P25800 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO1P25800 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO1P25800 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO1P25800 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO1P25800 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO1P25800 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO1P25800 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO1P25800 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO1P25800 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO1P25800 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO1P25800 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO1P25800 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO1P25800 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO1P25800 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO1P25800 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO1P25800 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO1P25800 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO1P25800 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO1P25800 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO1P25800 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO1P25800 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO1P25800 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO1P25800 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO1P25800 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO1P25800 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO1P25800 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO1P25800 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO1P25800 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO1P25800 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO1P25800 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO1P25800 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO1P25800 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO1P25800 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO1P25800 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO1P25800 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO1P25800 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO1P25800 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO1P25800 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO1P25800 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO1P25800 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO1P25800 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO1P25800 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO1P25800 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO1P25800 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO1P25800 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO1P25800 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO1P25800 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO1P25800 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO1P25800 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO1P25800 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO1P25800 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO1P25800 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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