Protein–RNA interactions for Protein: P22676

CALB2, Calretinin, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB2P22676 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALB2P22676 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALB2P22676 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALB2P22676 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALB2P22676 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALB2P22676 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALB2P22676 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALB2P22676 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALB2P22676 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALB2P22676 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALB2P22676 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALB2P22676 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALB2P22676 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CALB2P22676 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALB2P22676 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALB2P22676 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALB2P22676 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALB2P22676 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALB2P22676 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALB2P22676 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALB2P22676 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALB2P22676 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CALB2P22676 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALB2P22676 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALB2P22676 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALB2P22676 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALB2P22676 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALB2P22676 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALB2P22676 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALB2P22676 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALB2P22676 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALB2P22676 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALB2P22676 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALB2P22676 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALB2P22676 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALB2P22676 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALB2P22676 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALB2P22676 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALB2P22676 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALB2P22676 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALB2P22676 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALB2P22676 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALB2P22676 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALB2P22676 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALB2P22676 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALB2P22676 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALB2P22676 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALB2P22676 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALB2P22676 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALB2P22676 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALB2P22676 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CALB2P22676 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALB2P22676 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALB2P22676 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALB2P22676 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALB2P22676 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALB2P22676 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALB2P22676 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALB2P22676 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALB2P22676 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALB2P22676 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALB2P22676 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALB2P22676 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALB2P22676 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALB2P22676 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALB2P22676 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CALB2P22676 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CALB2P22676 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CALB2P22676 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CALB2P22676 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CALB2P22676 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CALB2P22676 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CALB2P22676 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CALB2P22676 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CALB2P22676 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CALB2P22676 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CALB2P22676 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CALB2P22676 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CALB2P22676 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CALB2P22676 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CALB2P22676 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CALB2P22676 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CALB2P22676 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CALB2P22676 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CALB2P22676 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CALB2P22676 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CALB2P22676 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CALB2P22676 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CALB2P22676 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CALB2P22676 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CALB2P22676 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CALB2P22676 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CALB2P22676 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CALB2P22676 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CALB2P22676 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CALB2P22676 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CALB2P22676 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CALB2P22676 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CALB2P22676 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CALB2P22676 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms