Protein–RNA interactions for Protein: P20807

CAPN3, Calpain-3, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3P20807 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CAPN3P20807 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CAPN3P20807 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CAPN3P20807 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CAPN3P20807 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CAPN3P20807 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CAPN3P20807 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CAPN3P20807 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPN3P20807 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPN3P20807 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPN3P20807 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPN3P20807 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPN3P20807 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPN3P20807 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPN3P20807 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPN3P20807 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPN3P20807 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPN3P20807 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPN3P20807 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPN3P20807 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPN3P20807 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPN3P20807 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPN3P20807 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPN3P20807 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPN3P20807 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPN3P20807 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPN3P20807 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPN3P20807 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPN3P20807 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPN3P20807 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPN3P20807 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPN3P20807 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPN3P20807 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPN3P20807 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPN3P20807 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPN3P20807 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPN3P20807 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPN3P20807 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPN3P20807 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPN3P20807 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPN3P20807 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPN3P20807 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPN3P20807 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPN3P20807 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPN3P20807 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPN3P20807 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPN3P20807 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPN3P20807 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPN3P20807 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CAPN3P20807 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CAPN3P20807 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CAPN3P20807 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CAPN3P20807 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CAPN3P20807 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CAPN3P20807 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CAPN3P20807 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CAPN3P20807 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CAPN3P20807 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CAPN3P20807 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CAPN3P20807 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CAPN3P20807 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CAPN3P20807 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CAPN3P20807 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CAPN3P20807 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAPN3P20807 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAPN3P20807 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAPN3P20807 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CAPN3P20807 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CAPN3P20807 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAPN3P20807 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CAPN3P20807 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAPN3P20807 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAPN3P20807 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CAPN3P20807 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAPN3P20807 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAPN3P20807 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CAPN3P20807 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CAPN3P20807 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CAPN3P20807 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CAPN3P20807 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CAPN3P20807 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CAPN3P20807 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CAPN3P20807 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CAPN3P20807 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAPN3P20807 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CAPN3P20807 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CAPN3P20807 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CAPN3P20807 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CAPN3P20807 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CAPN3P20807 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAPN3P20807 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CAPN3P20807 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CAPN3P20807 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAPN3P20807 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAPN3P20807 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CAPN3P20807 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CAPN3P20807 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CAPN3P20807 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CAPN3P20807 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CAPN3P20807 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms