Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms