Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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