Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB1P19838 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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NFKB1P19838 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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NFKB1P19838 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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NFKB1P19838 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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NFKB1P19838 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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