Protein–RNA interactions for Protein: P17481

HOXB8, Homeobox protein Hox-B8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB8P17481 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB8P17481 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB8P17481 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB8P17481 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB8P17481 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB8P17481 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms