Protein–RNA interactions for Protein: P15976

GATA1, Erythroid transcription factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA1P15976 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
GATA1P15976 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
GATA1P15976 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
GATA1P15976 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
GATA1P15976 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
GATA1P15976 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
GATA1P15976 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
GATA1P15976 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
GATA1P15976 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
GATA1P15976 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
GATA1P15976 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
GATA1P15976 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
GATA1P15976 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
GATA1P15976 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
GATA1P15976 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
GATA1P15976 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
GATA1P15976 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
GATA1P15976 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
GATA1P15976 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
GATA1P15976 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
GATA1P15976 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
GATA1P15976 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
GATA1P15976 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
GATA1P15976 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
GATA1P15976 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
GATA1P15976 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
GATA1P15976 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
GATA1P15976 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
GATA1P15976 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
GATA1P15976 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
GATA1P15976 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
GATA1P15976 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
GATA1P15976 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
GATA1P15976 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
GATA1P15976 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
GATA1P15976 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
GATA1P15976 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
GATA1P15976 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
GATA1P15976 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
GATA1P15976 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
GATA1P15976 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
GATA1P15976 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
GATA1P15976 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
GATA1P15976 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
GATA1P15976 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
GATA1P15976 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
GATA1P15976 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC11.56□□□□□ -0.56
GATA1P15976 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
GATA1P15976 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
GATA1P15976 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
GATA1P15976 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
GATA1P15976 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
GATA1P15976 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
GATA1P15976 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
GATA1P15976 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
GATA1P15976 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
GATA1P15976 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
GATA1P15976 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
GATA1P15976 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
GATA1P15976 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
GATA1P15976 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
GATA1P15976 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
GATA1P15976 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
GATA1P15976 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
GATA1P15976 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
GATA1P15976 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
GATA1P15976 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
GATA1P15976 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
GATA1P15976 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
GATA1P15976 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
GATA1P15976 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
GATA1P15976 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
GATA1P15976 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
GATA1P15976 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
GATA1P15976 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
GATA1P15976 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
GATA1P15976 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
GATA1P15976 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
GATA1P15976 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
GATA1P15976 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
GATA1P15976 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
GATA1P15976 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
GATA1P15976 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
GATA1P15976 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
GATA1P15976 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
GATA1P15976 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
GATA1P15976 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
GATA1P15976 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
GATA1P15976 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
GATA1P15976 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
GATA1P15976 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
GATA1P15976 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
GATA1P15976 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
GATA1P15976 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
GATA1P15976 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
GATA1P15976 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
GATA1P15976 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
GATA1P15976 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
GATA1P15976 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
GATA1P15976 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms