Protein–RNA interactions for Protein: P13073

COX4I1, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX4I1P13073 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX4I1P13073 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX4I1P13073 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX4I1P13073 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX4I1P13073 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX4I1P13073 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX4I1P13073 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX4I1P13073 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX4I1P13073 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX4I1P13073 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX4I1P13073 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
COX4I1P13073 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX4I1P13073 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX4I1P13073 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX4I1P13073 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX4I1P13073 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX4I1P13073 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
COX4I1P13073 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX4I1P13073 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX4I1P13073 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX4I1P13073 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX4I1P13073 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX4I1P13073 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX4I1P13073 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX4I1P13073 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX4I1P13073 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX4I1P13073 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX4I1P13073 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX4I1P13073 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX4I1P13073 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX4I1P13073 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX4I1P13073 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX4I1P13073 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
COX4I1P13073 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
COX4I1P13073 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX4I1P13073 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
COX4I1P13073 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX4I1P13073 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
COX4I1P13073 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX4I1P13073 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX4I1P13073 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX4I1P13073 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX4I1P13073 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
COX4I1P13073 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX4I1P13073 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX4I1P13073 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX4I1P13073 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX4I1P13073 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX4I1P13073 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX4I1P13073 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
COX4I1P13073 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
COX4I1P13073 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
COX4I1P13073 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
COX4I1P13073 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
COX4I1P13073 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
COX4I1P13073 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
COX4I1P13073 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
COX4I1P13073 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
COX4I1P13073 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
COX4I1P13073 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COX4I1P13073 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
COX4I1P13073 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COX4I1P13073 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.08■□□□□ 0
COX4I1P13073 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
COX4I1P13073 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COX4I1P13073 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
COX4I1P13073 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
COX4I1P13073 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
COX4I1P13073 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
COX4I1P13073 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
COX4I1P13073 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COX4I1P13073 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COX4I1P13073 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
COX4I1P13073 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
COX4I1P13073 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
COX4I1P13073 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
COX4I1P13073 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.08■□□□□ 0
COX4I1P13073 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COX4I1P13073 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COX4I1P13073 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COX4I1P13073 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
COX4I1P13073 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COX4I1P13073 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
COX4I1P13073 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COX4I1P13073 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COX4I1P13073 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COX4I1P13073 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COX4I1P13073 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
COX4I1P13073 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COX4I1P13073 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COX4I1P13073 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
COX4I1P13073 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
COX4I1P13073 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
COX4I1P13073 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COX4I1P13073 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
COX4I1P13073 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COX4I1P13073 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COX4I1P13073 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COX4I1P13073 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COX4I1P13073 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms