Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
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