Protein–RNA interactions for Protein: P02652

APOA2, Apolipoprotein A-II, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA2P02652 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
APOA2P02652 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
APOA2P02652 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
APOA2P02652 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
APOA2P02652 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
APOA2P02652 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
APOA2P02652 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
APOA2P02652 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
APOA2P02652 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
APOA2P02652 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
APOA2P02652 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
APOA2P02652 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
APOA2P02652 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
APOA2P02652 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
APOA2P02652 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
APOA2P02652 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
APOA2P02652 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
APOA2P02652 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
APOA2P02652 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
APOA2P02652 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
APOA2P02652 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
APOA2P02652 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
APOA2P02652 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
APOA2P02652 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APOA2P02652 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APOA2P02652 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
APOA2P02652 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
APOA2P02652 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APOA2P02652 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
APOA2P02652 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
APOA2P02652 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
APOA2P02652 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APOA2P02652 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APOA2P02652 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
APOA2P02652 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
APOA2P02652 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APOA2P02652 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APOA2P02652 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APOA2P02652 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
APOA2P02652 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
APOA2P02652 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APOA2P02652 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APOA2P02652 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
APOA2P02652 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
APOA2P02652 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APOA2P02652 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
APOA2P02652 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
APOA2P02652 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APOA2P02652 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APOA2P02652 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
APOA2P02652 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APOA2P02652 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APOA2P02652 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APOA2P02652 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APOA2P02652 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APOA2P02652 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
APOA2P02652 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
APOA2P02652 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
APOA2P02652 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APOA2P02652 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
APOA2P02652 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
APOA2P02652 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
APOA2P02652 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APOA2P02652 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
APOA2P02652 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
APOA2P02652 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APOA2P02652 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
APOA2P02652 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APOA2P02652 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APOA2P02652 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
APOA2P02652 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
APOA2P02652 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
APOA2P02652 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
APOA2P02652 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
APOA2P02652 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
APOA2P02652 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
APOA2P02652 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APOA2P02652 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
APOA2P02652 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
APOA2P02652 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
APOA2P02652 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
APOA2P02652 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
APOA2P02652 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
APOA2P02652 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
APOA2P02652 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
APOA2P02652 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
APOA2P02652 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
APOA2P02652 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
APOA2P02652 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
APOA2P02652 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
APOA2P02652 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
APOA2P02652 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
APOA2P02652 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
APOA2P02652 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
APOA2P02652 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
APOA2P02652 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
APOA2P02652 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
APOA2P02652 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
APOA2P02652 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
APOA2P02652 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms