Protein–RNA interactions for Protein: O43900

PRICKLE3, Prickle planar cell polarity protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRICKLE3O43900 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PRICKLE3O43900 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PRICKLE3O43900 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PRICKLE3O43900 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PRICKLE3O43900 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PRICKLE3O43900 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PRICKLE3O43900 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PRICKLE3O43900 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PRICKLE3O43900 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PRICKLE3O43900 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRICKLE3O43900 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRICKLE3O43900 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRICKLE3O43900 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRICKLE3O43900 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRICKLE3O43900 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRICKLE3O43900 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRICKLE3O43900 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRICKLE3O43900 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRICKLE3O43900 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRICKLE3O43900 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRICKLE3O43900 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRICKLE3O43900 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRICKLE3O43900 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRICKLE3O43900 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRICKLE3O43900 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRICKLE3O43900 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRICKLE3O43900 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRICKLE3O43900 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRICKLE3O43900 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PRICKLE3O43900 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRICKLE3O43900 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PRICKLE3O43900 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRICKLE3O43900 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRICKLE3O43900 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRICKLE3O43900 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PRICKLE3O43900 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRICKLE3O43900 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRICKLE3O43900 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRICKLE3O43900 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRICKLE3O43900 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRICKLE3O43900 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRICKLE3O43900 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRICKLE3O43900 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRICKLE3O43900 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRICKLE3O43900 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRICKLE3O43900 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRICKLE3O43900 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRICKLE3O43900 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRICKLE3O43900 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRICKLE3O43900 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRICKLE3O43900 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PRICKLE3O43900 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRICKLE3O43900 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRICKLE3O43900 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRICKLE3O43900 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRICKLE3O43900 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRICKLE3O43900 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRICKLE3O43900 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRICKLE3O43900 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRICKLE3O43900 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRICKLE3O43900 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRICKLE3O43900 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRICKLE3O43900 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRICKLE3O43900 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRICKLE3O43900 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRICKLE3O43900 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRICKLE3O43900 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRICKLE3O43900 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRICKLE3O43900 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRICKLE3O43900 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRICKLE3O43900 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRICKLE3O43900 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRICKLE3O43900 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PRICKLE3O43900 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRICKLE3O43900 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRICKLE3O43900 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRICKLE3O43900 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRICKLE3O43900 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PRICKLE3O43900 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRICKLE3O43900 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRICKLE3O43900 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRICKLE3O43900 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRICKLE3O43900 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRICKLE3O43900 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PRICKLE3O43900 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRICKLE3O43900 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRICKLE3O43900 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PRICKLE3O43900 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRICKLE3O43900 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRICKLE3O43900 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRICKLE3O43900 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRICKLE3O43900 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRICKLE3O43900 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRICKLE3O43900 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRICKLE3O43900 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRICKLE3O43900 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRICKLE3O43900 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRICKLE3O43900 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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