Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms