Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.58□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC12.58□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC12.58□□□□□ -0.4
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