Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PHF1O43189 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PHF1O43189 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PHF1O43189 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PHF1O43189 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PHF1O43189 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PHF1O43189 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF1O43189 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF1O43189 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF1O43189 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF1O43189 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF1O43189 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF1O43189 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF1O43189 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF1O43189 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF1O43189 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF1O43189 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF1O43189 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF1O43189 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF1O43189 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF1O43189 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF1O43189 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF1O43189 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF1O43189 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF1O43189 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF1O43189 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF1O43189 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF1O43189 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF1O43189 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF1O43189 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF1O43189 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF1O43189 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF1O43189 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF1O43189 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF1O43189 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF1O43189 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF1O43189 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF1O43189 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF1O43189 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF1O43189 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF1O43189 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF1O43189 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF1O43189 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF1O43189 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF1O43189 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF1O43189 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF1O43189 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF1O43189 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF1O43189 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF1O43189 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF1O43189 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF1O43189 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF1O43189 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF1O43189 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF1O43189 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF1O43189 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PHF1O43189 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PHF1O43189 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PHF1O43189 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PHF1O43189 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PHF1O43189 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PHF1O43189 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHF1O43189 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHF1O43189 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHF1O43189 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHF1O43189 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHF1O43189 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHF1O43189 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHF1O43189 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHF1O43189 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHF1O43189 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHF1O43189 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHF1O43189 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHF1O43189 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHF1O43189 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHF1O43189 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHF1O43189 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHF1O43189 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHF1O43189 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHF1O43189 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHF1O43189 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PHF1O43189 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PHF1O43189 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PHF1O43189 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHF1O43189 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHF1O43189 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHF1O43189 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHF1O43189 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHF1O43189 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHF1O43189 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHF1O43189 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHF1O43189 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHF1O43189 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHF1O43189 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHF1O43189 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHF1O43189 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHF1O43189 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHF1O43189 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHF1O43189 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHF1O43189 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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