Protein–RNA interactions for Protein: O43181

NDUFS4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS4O43181 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms