Protein–RNA interactions for Protein: O15054

KDM6B, Lysine-specific demethylase 6B, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6BO15054 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
KDM6BO15054 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDM6BO15054 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDM6BO15054 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDM6BO15054 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDM6BO15054 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDM6BO15054 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDM6BO15054 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDM6BO15054 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDM6BO15054 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDM6BO15054 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDM6BO15054 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDM6BO15054 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDM6BO15054 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDM6BO15054 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDM6BO15054 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDM6BO15054 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDM6BO15054 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDM6BO15054 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
KDM6BO15054 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDM6BO15054 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
KDM6BO15054 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDM6BO15054 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
KDM6BO15054 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDM6BO15054 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDM6BO15054 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDM6BO15054 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDM6BO15054 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDM6BO15054 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDM6BO15054 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDM6BO15054 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDM6BO15054 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDM6BO15054 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDM6BO15054 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDM6BO15054 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms