Protein–RNA interactions for Protein: O00451

GFRA2, GDNF family receptor alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA2O00451 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GFRA2O00451 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GFRA2O00451 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GFRA2O00451 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GFRA2O00451 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GFRA2O00451 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GFRA2O00451 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GFRA2O00451 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GFRA2O00451 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GFRA2O00451 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GFRA2O00451 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GFRA2O00451 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GFRA2O00451 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GFRA2O00451 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GFRA2O00451 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GFRA2O00451 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GFRA2O00451 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GFRA2O00451 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GFRA2O00451 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GFRA2O00451 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GFRA2O00451 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GFRA2O00451 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GFRA2O00451 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GFRA2O00451 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GFRA2O00451 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GFRA2O00451 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GFRA2O00451 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GFRA2O00451 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GFRA2O00451 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GFRA2O00451 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GFRA2O00451 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GFRA2O00451 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GFRA2O00451 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GFRA2O00451 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GFRA2O00451 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GFRA2O00451 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GFRA2O00451 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GFRA2O00451 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GFRA2O00451 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GFRA2O00451 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GFRA2O00451 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GFRA2O00451 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GFRA2O00451 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GFRA2O00451 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GFRA2O00451 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GFRA2O00451 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GFRA2O00451 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GFRA2O00451 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GFRA2O00451 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GFRA2O00451 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GFRA2O00451 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GFRA2O00451 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GFRA2O00451 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GFRA2O00451 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GFRA2O00451 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GFRA2O00451 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GFRA2O00451 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GFRA2O00451 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GFRA2O00451 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GFRA2O00451 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GFRA2O00451 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GFRA2O00451 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GFRA2O00451 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GFRA2O00451 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GFRA2O00451 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GFRA2O00451 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GFRA2O00451 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GFRA2O00451 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GFRA2O00451 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GFRA2O00451 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GFRA2O00451 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GFRA2O00451 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GFRA2O00451 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GFRA2O00451 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GFRA2O00451 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GFRA2O00451 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GFRA2O00451 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GFRA2O00451 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GFRA2O00451 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GFRA2O00451 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GFRA2O00451 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GFRA2O00451 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GFRA2O00451 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GFRA2O00451 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GFRA2O00451 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GFRA2O00451 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GFRA2O00451 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GFRA2O00451 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GFRA2O00451 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GFRA2O00451 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GFRA2O00451 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GFRA2O00451 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GFRA2O00451 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GFRA2O00451 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GFRA2O00451 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
GFRA2O00451 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GFRA2O00451 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GFRA2O00451 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GFRA2O00451 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GFRA2O00451 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms