Protein–RNA interactions for Protein: A6NGN4

PRAMEF25, PRAME family member 25, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF25A6NGN4 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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