Protein–RNA interactions for Protein: A4D0V7

CPED1, Cadherin-like and PC-esterase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPED1A4D0V7 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CPED1A4D0V7 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CPED1A4D0V7 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CPED1A4D0V7 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CPED1A4D0V7 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CPED1A4D0V7 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CPED1A4D0V7 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CPED1A4D0V7 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CPED1A4D0V7 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CPED1A4D0V7 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CPED1A4D0V7 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CPED1A4D0V7 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CPED1A4D0V7 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CPED1A4D0V7 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CPED1A4D0V7 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CPED1A4D0V7 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CPED1A4D0V7 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CPED1A4D0V7 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CPED1A4D0V7 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CPED1A4D0V7 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CPED1A4D0V7 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CPED1A4D0V7 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CPED1A4D0V7 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CPED1A4D0V7 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CPED1A4D0V7 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CPED1A4D0V7 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CPED1A4D0V7 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CPED1A4D0V7 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CPED1A4D0V7 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CPED1A4D0V7 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CPED1A4D0V7 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CPED1A4D0V7 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CPED1A4D0V7 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CPED1A4D0V7 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CPED1A4D0V7 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CPED1A4D0V7 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CPED1A4D0V7 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CPED1A4D0V7 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CPED1A4D0V7 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CPED1A4D0V7 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CPED1A4D0V7 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CPED1A4D0V7 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CPED1A4D0V7 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CPED1A4D0V7 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CPED1A4D0V7 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CPED1A4D0V7 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CPED1A4D0V7 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CPED1A4D0V7 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CPED1A4D0V7 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CPED1A4D0V7 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CPED1A4D0V7 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CPED1A4D0V7 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CPED1A4D0V7 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CPED1A4D0V7 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CPED1A4D0V7 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CPED1A4D0V7 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CPED1A4D0V7 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CPED1A4D0V7 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CPED1A4D0V7 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CPED1A4D0V7 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CPED1A4D0V7 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CPED1A4D0V7 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CPED1A4D0V7 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CPED1A4D0V7 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CPED1A4D0V7 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CPED1A4D0V7 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CPED1A4D0V7 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CPED1A4D0V7 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CPED1A4D0V7 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CPED1A4D0V7 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CPED1A4D0V7 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CPED1A4D0V7 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CPED1A4D0V7 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CPED1A4D0V7 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CPED1A4D0V7 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CPED1A4D0V7 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CPED1A4D0V7 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CPED1A4D0V7 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CPED1A4D0V7 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CPED1A4D0V7 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CPED1A4D0V7 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CPED1A4D0V7 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CPED1A4D0V7 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CPED1A4D0V7 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CPED1A4D0V7 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CPED1A4D0V7 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CPED1A4D0V7 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CPED1A4D0V7 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CPED1A4D0V7 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CPED1A4D0V7 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CPED1A4D0V7 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CPED1A4D0V7 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CPED1A4D0V7 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CPED1A4D0V7 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CPED1A4D0V7 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CPED1A4D0V7 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CPED1A4D0V7 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CPED1A4D0V7 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CPED1A4D0V7 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CPED1A4D0V7 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms