Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms