Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM35Q9UPQ4 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM35Q9UPQ4 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM35Q9UPQ4 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM35Q9UPQ4 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM35Q9UPQ4 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM35Q9UPQ4 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM35Q9UPQ4 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM35Q9UPQ4 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM35Q9UPQ4 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM35Q9UPQ4 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM35Q9UPQ4 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM35Q9UPQ4 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM35Q9UPQ4 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM35Q9UPQ4 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM35Q9UPQ4 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM35Q9UPQ4 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM35Q9UPQ4 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM35Q9UPQ4 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM35Q9UPQ4 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM35Q9UPQ4 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM35Q9UPQ4 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM35Q9UPQ4 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM35Q9UPQ4 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM35Q9UPQ4 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM35Q9UPQ4 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM35Q9UPQ4 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM35Q9UPQ4 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM35Q9UPQ4 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM35Q9UPQ4 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM35Q9UPQ4 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM35Q9UPQ4 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM35Q9UPQ4 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM35Q9UPQ4 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM35Q9UPQ4 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TRIM35Q9UPQ4 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TRIM35Q9UPQ4 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TRIM35Q9UPQ4 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TRIM35Q9UPQ4 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TRIM35Q9UPQ4 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM35Q9UPQ4 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM35Q9UPQ4 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM35Q9UPQ4 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM35Q9UPQ4 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM35Q9UPQ4 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM35Q9UPQ4 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM35Q9UPQ4 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM35Q9UPQ4 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM35Q9UPQ4 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM35Q9UPQ4 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM35Q9UPQ4 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM35Q9UPQ4 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM35Q9UPQ4 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM35Q9UPQ4 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM35Q9UPQ4 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM35Q9UPQ4 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM35Q9UPQ4 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM35Q9UPQ4 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM35Q9UPQ4 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM35Q9UPQ4 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM35Q9UPQ4 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM35Q9UPQ4 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM35Q9UPQ4 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM35Q9UPQ4 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM35Q9UPQ4 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM35Q9UPQ4 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM35Q9UPQ4 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM35Q9UPQ4 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM35Q9UPQ4 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM35Q9UPQ4 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM35Q9UPQ4 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM35Q9UPQ4 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM35Q9UPQ4 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM35Q9UPQ4 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM35Q9UPQ4 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM35Q9UPQ4 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM35Q9UPQ4 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM35Q9UPQ4 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM35Q9UPQ4 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM35Q9UPQ4 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM35Q9UPQ4 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM35Q9UPQ4 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM35Q9UPQ4 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM35Q9UPQ4 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM35Q9UPQ4 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM35Q9UPQ4 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM35Q9UPQ4 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM35Q9UPQ4 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM35Q9UPQ4 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM35Q9UPQ4 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM35Q9UPQ4 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM35Q9UPQ4 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM35Q9UPQ4 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM35Q9UPQ4 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM35Q9UPQ4 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM35Q9UPQ4 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM35Q9UPQ4 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM35Q9UPQ4 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM35Q9UPQ4 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM35Q9UPQ4 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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