Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms