Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms