Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms