Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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