Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY4

DNAJB4, DnaJ homolog subfamily B member 4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB4Q9UDY4 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNAJB4Q9UDY4 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNAJB4Q9UDY4 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNAJB4Q9UDY4 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNAJB4Q9UDY4 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNAJB4Q9UDY4 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNAJB4Q9UDY4 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJB4Q9UDY4 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJB4Q9UDY4 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJB4Q9UDY4 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJB4Q9UDY4 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJB4Q9UDY4 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJB4Q9UDY4 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJB4Q9UDY4 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJB4Q9UDY4 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJB4Q9UDY4 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJB4Q9UDY4 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJB4Q9UDY4 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJB4Q9UDY4 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJB4Q9UDY4 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJB4Q9UDY4 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJB4Q9UDY4 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJB4Q9UDY4 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJB4Q9UDY4 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJB4Q9UDY4 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJB4Q9UDY4 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJB4Q9UDY4 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJB4Q9UDY4 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJB4Q9UDY4 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJB4Q9UDY4 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJB4Q9UDY4 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJB4Q9UDY4 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJB4Q9UDY4 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJB4Q9UDY4 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJB4Q9UDY4 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJB4Q9UDY4 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJB4Q9UDY4 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJB4Q9UDY4 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJB4Q9UDY4 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJB4Q9UDY4 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJB4Q9UDY4 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJB4Q9UDY4 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJB4Q9UDY4 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJB4Q9UDY4 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJB4Q9UDY4 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJB4Q9UDY4 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJB4Q9UDY4 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJB4Q9UDY4 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJB4Q9UDY4 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJB4Q9UDY4 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJB4Q9UDY4 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJB4Q9UDY4 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJB4Q9UDY4 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJB4Q9UDY4 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJB4Q9UDY4 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJB4Q9UDY4 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJB4Q9UDY4 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJB4Q9UDY4 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJB4Q9UDY4 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJB4Q9UDY4 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJB4Q9UDY4 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJB4Q9UDY4 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJB4Q9UDY4 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJB4Q9UDY4 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJB4Q9UDY4 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJB4Q9UDY4 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJB4Q9UDY4 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJB4Q9UDY4 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJB4Q9UDY4 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJB4Q9UDY4 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJB4Q9UDY4 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJB4Q9UDY4 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJB4Q9UDY4 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJB4Q9UDY4 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJB4Q9UDY4 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJB4Q9UDY4 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJB4Q9UDY4 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJB4Q9UDY4 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJB4Q9UDY4 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJB4Q9UDY4 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJB4Q9UDY4 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJB4Q9UDY4 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJB4Q9UDY4 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
DNAJB4Q9UDY4 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNAJB4Q9UDY4 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNAJB4Q9UDY4 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNAJB4Q9UDY4 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNAJB4Q9UDY4 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNAJB4Q9UDY4 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNAJB4Q9UDY4 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNAJB4Q9UDY4 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNAJB4Q9UDY4 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNAJB4Q9UDY4 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNAJB4Q9UDY4 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNAJB4Q9UDY4 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNAJB4Q9UDY4 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNAJB4Q9UDY4 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNAJB4Q9UDY4 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNAJB4Q9UDY4 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNAJB4Q9UDY4 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms