Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms