Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
POLKQ9UBT6 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
POLKQ9UBT6 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
POLKQ9UBT6 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
POLKQ9UBT6 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
POLKQ9UBT6 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
POLKQ9UBT6 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
POLKQ9UBT6 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
POLKQ9UBT6 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
POLKQ9UBT6 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLKQ9UBT6 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLKQ9UBT6 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLKQ9UBT6 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLKQ9UBT6 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLKQ9UBT6 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLKQ9UBT6 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLKQ9UBT6 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLKQ9UBT6 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLKQ9UBT6 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLKQ9UBT6 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLKQ9UBT6 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLKQ9UBT6 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLKQ9UBT6 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLKQ9UBT6 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLKQ9UBT6 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLKQ9UBT6 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLKQ9UBT6 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLKQ9UBT6 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLKQ9UBT6 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLKQ9UBT6 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLKQ9UBT6 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLKQ9UBT6 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
POLKQ9UBT6 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLKQ9UBT6 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLKQ9UBT6 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLKQ9UBT6 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLKQ9UBT6 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLKQ9UBT6 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLKQ9UBT6 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLKQ9UBT6 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLKQ9UBT6 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLKQ9UBT6 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLKQ9UBT6 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLKQ9UBT6 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLKQ9UBT6 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLKQ9UBT6 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLKQ9UBT6 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLKQ9UBT6 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLKQ9UBT6 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLKQ9UBT6 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLKQ9UBT6 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLKQ9UBT6 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLKQ9UBT6 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLKQ9UBT6 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLKQ9UBT6 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLKQ9UBT6 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms