Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms