Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD26

GOPC, Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOPCQ9HD26 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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