Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms