Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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