Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 TUBB8P7-202ENST00000564451 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 TLE3-220ENST00000559929 3408 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 ZNF410-201ENST00000324593 2293 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 CCDC60-201ENST00000327554 2450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 ALDH18A1-202ENST00000371224 3359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 DDX12P-201ENST00000432996 2947 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 PNPO-217ENST00000642017 3465 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 MUC20-205ENST00000447234 2589 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 TLE3-208ENST00000557907 2295 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 PARP3-202ENST00000417220 2472 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 FZD7-201ENST00000286201 3859 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 SPACA9-202ENST00000356311 2243 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 CCDC114-201ENST00000315396 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 LINC00846-201ENST00000334165 1778 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 SPATA2-202ENST00000422556 4138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 AC012485.1-201ENST00000456601 2509 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 MATR3-227ENST00000618441 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 L3MBTL1-203ENST00000373135 3218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 AC008806.1-201ENST00000624962 2443 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 SLC44A4-202ENST00000229729 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 CPA5-208ENST00000485477 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 EME1-202ENST00000393271 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms