Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS0

COL25A1, Collagen alpha-1(XXV) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL25A1Q9BXS0 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL25A1Q9BXS0 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL25A1Q9BXS0 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL25A1Q9BXS0 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL25A1Q9BXS0 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL25A1Q9BXS0 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL25A1Q9BXS0 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL25A1Q9BXS0 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL25A1Q9BXS0 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL25A1Q9BXS0 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL25A1Q9BXS0 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL25A1Q9BXS0 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL25A1Q9BXS0 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL25A1Q9BXS0 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL25A1Q9BXS0 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL25A1Q9BXS0 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL25A1Q9BXS0 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL25A1Q9BXS0 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
COL25A1Q9BXS0 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL25A1Q9BXS0 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL25A1Q9BXS0 AC026412.1-206ENST00000502273 206 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
COL25A1Q9BXS0 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
COL25A1Q9BXS0 AC008750.2-201ENST00000526996 627 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL25A1Q9BXS0 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
COL25A1Q9BXS0 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL25A1Q9BXS0 MIR4254-201ENST00000581063 76 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
COL25A1Q9BXS0 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
COL25A1Q9BXS0 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL25A1Q9BXS0 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
COL25A1Q9BXS0 POU5F1-207ENST00000606567 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL25A1Q9BXS0 KCNQ1OT1_1.1-201ENST00000622358 464 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
COL25A1Q9BXS0 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL25A1Q9BXS0 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL25A1Q9BXS0 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL25A1Q9BXS0 NNMT-203ENST00000535401 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL25A1Q9BXS0 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL25A1Q9BXS0 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL25A1Q9BXS0 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL25A1Q9BXS0 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL25A1Q9BXS0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL25A1Q9BXS0 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL25A1Q9BXS0 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
COL25A1Q9BXS0 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL25A1Q9BXS0 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL25A1Q9BXS0 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL25A1Q9BXS0 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL25A1Q9BXS0 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL25A1Q9BXS0 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL25A1Q9BXS0 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL25A1Q9BXS0 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL25A1Q9BXS0 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL25A1Q9BXS0 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL25A1Q9BXS0 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL25A1Q9BXS0 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL25A1Q9BXS0 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL25A1Q9BXS0 IL1F10-201ENST00000341010 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL25A1Q9BXS0 TOMM5-203ENST00000401811 789 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL25A1Q9BXS0 DNM1P48-201ENST00000419538 439 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
COL25A1Q9BXS0 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL25A1Q9BXS0 PEBP1P3-201ENST00000455475 548 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
COL25A1Q9BXS0 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL25A1Q9BXS0 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
COL25A1Q9BXS0 AC113347.2-201ENST00000512350 279 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
COL25A1Q9BXS0 ABCC6P2-201ENST00000526069 590 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
COL25A1Q9BXS0 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
COL25A1Q9BXS0 LINC02352-201ENST00000557928 468 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL25A1Q9BXS0 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL25A1Q9BXS0 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL25A1Q9BXS0 Z99916.3-201ENST00000623422 1080 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
COL25A1Q9BXS0 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL25A1Q9BXS0 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL25A1Q9BXS0 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL25A1Q9BXS0 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL25A1Q9BXS0 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL25A1Q9BXS0 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
COL25A1Q9BXS0 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
COL25A1Q9BXS0 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL25A1Q9BXS0 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL25A1Q9BXS0 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL25A1Q9BXS0 GNG4-201ENST00000366597 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL25A1Q9BXS0 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL25A1Q9BXS0 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL25A1Q9BXS0 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL25A1Q9BXS0 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL25A1Q9BXS0 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL25A1Q9BXS0 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL25A1Q9BXS0 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL25A1Q9BXS0 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
COL25A1Q9BXS0 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL25A1Q9BXS0 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
COL25A1Q9BXS0 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL25A1Q9BXS0 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL25A1Q9BXS0 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL25A1Q9BXS0 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL25A1Q9BXS0 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL25A1Q9BXS0 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL25A1Q9BXS0 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL25A1Q9BXS0 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL25A1Q9BXS0 MED15P3-201ENST00000413613 326 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
COL25A1Q9BXS0 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms