Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms