Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP8Q9BV40 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP8Q9BV40 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP8Q9BV40 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP8Q9BV40 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP8Q9BV40 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP8Q9BV40 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP8Q9BV40 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP8Q9BV40 ATP11A-201ENST00000375630 8768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP8Q9BV40 RFWD3-201ENST00000361070 4957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP8Q9BV40 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP8Q9BV40 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP8Q9BV40 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP8Q9BV40 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP8Q9BV40 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP8Q9BV40 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP8Q9BV40 GRHL2-201ENST00000251808 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP8Q9BV40 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP8Q9BV40 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP8Q9BV40 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP8Q9BV40 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VAMP8Q9BV40 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VAMP8Q9BV40 AC022497.1-201ENST00000624916 3691 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
VAMP8Q9BV40 DNMT1-203ENST00000540357 4916 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
VAMP8Q9BV40 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VAMP8Q9BV40 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VAMP8Q9BV40 GRM4-203ENST00000455714 2574 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
VAMP8Q9BV40 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VAMP8Q9BV40 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VAMP8Q9BV40 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VAMP8Q9BV40 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
VAMP8Q9BV40 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
VAMP8Q9BV40 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
VAMP8Q9BV40 LHCGR-201ENST00000294954 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VAMP8Q9BV40 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
VAMP8Q9BV40 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
VAMP8Q9BV40 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
VAMP8Q9BV40 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
VAMP8Q9BV40 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VAMP8Q9BV40 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
VAMP8Q9BV40 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
VAMP8Q9BV40 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC11.4□□□□□ -0.58
VAMP8Q9BV40 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
VAMP8Q9BV40 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
VAMP8Q9BV40 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
VAMP8Q9BV40 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VAMP8Q9BV40 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
VAMP8Q9BV40 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC11.4□□□□□ -0.58
VAMP8Q9BV40 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
VAMP8Q9BV40 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
VAMP8Q9BV40 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
VAMP8Q9BV40 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VAMP8Q9BV40 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
VAMP8Q9BV40 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
VAMP8Q9BV40 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VAMP8Q9BV40 CRY2-212ENST00000616623 4204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VAMP8Q9BV40 LRRC15-201ENST00000347624 5883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VAMP8Q9BV40 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
VAMP8Q9BV40 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VAMP8Q9BV40 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
VAMP8Q9BV40 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VAMP8Q9BV40 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 CNKSR3-204ENST00000479339 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 GFRA1-203ENST00000369236 9109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 GOLGA3-201ENST00000204726 9252 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 RPL31-207ENST00000409711 2328 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 TRPM5-201ENST00000155858 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 RBM47-201ENST00000295971 4056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 NEDD4L-208ENST00000456173 4978 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 ADNP-203ENST00000396029 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 PLEKHG2-203ENST00000425673 8132 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 PDE9A-201ENST00000291539 2058 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 ESYT1-202ENST00000394048 4388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 GPR173-201ENST00000332582 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92 ms