Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms