Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 CBR3-AS1-213ENST00000623647 815 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 ATXN3-201ENST00000340660 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 C20orf85-201ENST00000371168 803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 FRGCA-201ENST00000424933 422 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms