Protein–RNA interactions for Protein: Q96T59

CDRT15, CMT1A duplicated region transcript 15 protein, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT15Q96T59 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDRT15Q96T59 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDRT15Q96T59 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDRT15Q96T59 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDRT15Q96T59 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDRT15Q96T59 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDRT15Q96T59 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDRT15Q96T59 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDRT15Q96T59 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDRT15Q96T59 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDRT15Q96T59 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDRT15Q96T59 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDRT15Q96T59 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDRT15Q96T59 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDRT15Q96T59 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDRT15Q96T59 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDRT15Q96T59 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDRT15Q96T59 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDRT15Q96T59 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CDRT15Q96T59 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDRT15Q96T59 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDRT15Q96T59 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CDRT15Q96T59 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDRT15Q96T59 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CDRT15Q96T59 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDRT15Q96T59 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDRT15Q96T59 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDRT15Q96T59 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDRT15Q96T59 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDRT15Q96T59 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDRT15Q96T59 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CDRT15Q96T59 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CDRT15Q96T59 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CDRT15Q96T59 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CDRT15Q96T59 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CDRT15Q96T59 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CDRT15Q96T59 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDRT15Q96T59 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDRT15Q96T59 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDRT15Q96T59 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDRT15Q96T59 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CDRT15Q96T59 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CDRT15Q96T59 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
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CDRT15Q96T59 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDRT15Q96T59 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CDRT15Q96T59 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDRT15Q96T59 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDRT15Q96T59 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDRT15Q96T59 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDRT15Q96T59 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDRT15Q96T59 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDRT15Q96T59 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDRT15Q96T59 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDRT15Q96T59 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDRT15Q96T59 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDRT15Q96T59 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CDRT15Q96T59 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDRT15Q96T59 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CDRT15Q96T59 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDRT15Q96T59 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDRT15Q96T59 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDRT15Q96T59 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDRT15Q96T59 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDRT15Q96T59 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CDRT15Q96T59 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CDRT15Q96T59 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDRT15Q96T59 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDRT15Q96T59 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDRT15Q96T59 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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CDRT15Q96T59 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDRT15Q96T59 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.02■□□□□ -0
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CDRT15Q96T59 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CDRT15Q96T59 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDRT15Q96T59 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CDRT15Q96T59 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CDRT15Q96T59 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CDRT15Q96T59 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CDRT15Q96T59 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CDRT15Q96T59 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDRT15Q96T59 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CDRT15Q96T59 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
CDRT15Q96T59 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CDRT15Q96T59 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CDRT15Q96T59 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CDRT15Q96T59 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CDRT15Q96T59 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
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