Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms