Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR9

APOLD1, Apolipoprotein L domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOLD1Q96LR9 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms