Protein–RNA interactions for Protein: Q96L92

SNX27, Sorting nexin-27, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX27Q96L92 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX27Q96L92 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX27Q96L92 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX27Q96L92 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX27Q96L92 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX27Q96L92 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX27Q96L92 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX27Q96L92 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX27Q96L92 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX27Q96L92 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX27Q96L92 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX27Q96L92 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX27Q96L92 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX27Q96L92 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX27Q96L92 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX27Q96L92 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX27Q96L92 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX27Q96L92 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX27Q96L92 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX27Q96L92 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX27Q96L92 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX27Q96L92 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX27Q96L92 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX27Q96L92 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX27Q96L92 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX27Q96L92 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX27Q96L92 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX27Q96L92 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX27Q96L92 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX27Q96L92 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX27Q96L92 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX27Q96L92 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX27Q96L92 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX27Q96L92 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX27Q96L92 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX27Q96L92 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX27Q96L92 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX27Q96L92 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX27Q96L92 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX27Q96L92 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX27Q96L92 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX27Q96L92 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX27Q96L92 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX27Q96L92 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX27Q96L92 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX27Q96L92 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX27Q96L92 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX27Q96L92 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX27Q96L92 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX27Q96L92 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX27Q96L92 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX27Q96L92 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX27Q96L92 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX27Q96L92 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX27Q96L92 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX27Q96L92 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX27Q96L92 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX27Q96L92 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX27Q96L92 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX27Q96L92 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX27Q96L92 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX27Q96L92 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX27Q96L92 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX27Q96L92 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX27Q96L92 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX27Q96L92 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX27Q96L92 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX27Q96L92 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX27Q96L92 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX27Q96L92 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX27Q96L92 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX27Q96L92 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX27Q96L92 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX27Q96L92 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX27Q96L92 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX27Q96L92 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX27Q96L92 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX27Q96L92 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX27Q96L92 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX27Q96L92 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX27Q96L92 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX27Q96L92 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX27Q96L92 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX27Q96L92 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX27Q96L92 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX27Q96L92 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX27Q96L92 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX27Q96L92 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX27Q96L92 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX27Q96L92 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX27Q96L92 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX27Q96L92 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX27Q96L92 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX27Q96L92 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX27Q96L92 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX27Q96L92 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX27Q96L92 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX27Q96L92 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX27Q96L92 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX27Q96L92 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms