Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX4

RSPRY1, RING finger and SPRY domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPRY1Q96DX4 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms