Protein–RNA interactions for Protein: Q96D59

RNF183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF183Q96D59 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms