Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms