Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ69

C11orf40, Putative uncharacterized protein C11orf40, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf40Q8WZ69 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms