Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM41Q8WV44 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
TRIM41Q8WV44 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
TRIM41Q8WV44 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM41Q8WV44 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM41Q8WV44 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM41Q8WV44 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM41Q8WV44 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM41Q8WV44 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM41Q8WV44 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM41Q8WV44 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM41Q8WV44 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM41Q8WV44 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM41Q8WV44 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM41Q8WV44 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM41Q8WV44 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM41Q8WV44 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM41Q8WV44 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM41Q8WV44 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM41Q8WV44 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM41Q8WV44 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM41Q8WV44 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM41Q8WV44 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM41Q8WV44 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM41Q8WV44 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM41Q8WV44 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM41Q8WV44 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM41Q8WV44 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM41Q8WV44 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM41Q8WV44 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM41Q8WV44 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM41Q8WV44 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM41Q8WV44 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM41Q8WV44 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM41Q8WV44 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM41Q8WV44 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM41Q8WV44 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM41Q8WV44 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM41Q8WV44 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM41Q8WV44 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM41Q8WV44 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM41Q8WV44 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM41Q8WV44 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM41Q8WV44 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM41Q8WV44 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM41Q8WV44 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM41Q8WV44 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms