Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
DCAF4Q8WV16 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
DCAF4Q8WV16 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
DCAF4Q8WV16 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
DCAF4Q8WV16 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCAF4Q8WV16 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCAF4Q8WV16 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCAF4Q8WV16 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCAF4Q8WV16 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCAF4Q8WV16 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCAF4Q8WV16 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCAF4Q8WV16 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCAF4Q8WV16 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCAF4Q8WV16 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
DCAF4Q8WV16 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCAF4Q8WV16 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCAF4Q8WV16 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCAF4Q8WV16 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCAF4Q8WV16 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCAF4Q8WV16 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCAF4Q8WV16 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCAF4Q8WV16 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCAF4Q8WV16 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCAF4Q8WV16 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCAF4Q8WV16 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF4Q8WV16 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF4Q8WV16 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF4Q8WV16 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF4Q8WV16 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF4Q8WV16 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF4Q8WV16 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF4Q8WV16 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF4Q8WV16 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF4Q8WV16 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF4Q8WV16 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF4Q8WV16 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF4Q8WV16 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF4Q8WV16 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF4Q8WV16 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF4Q8WV16 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF4Q8WV16 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF4Q8WV16 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF4Q8WV16 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF4Q8WV16 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF4Q8WV16 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF4Q8WV16 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF4Q8WV16 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF4Q8WV16 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF4Q8WV16 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF4Q8WV16 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF4Q8WV16 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF4Q8WV16 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF4Q8WV16 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF4Q8WV16 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF4Q8WV16 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF4Q8WV16 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF4Q8WV16 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF4Q8WV16 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF4Q8WV16 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF4Q8WV16 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF4Q8WV16 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF4Q8WV16 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF4Q8WV16 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF4Q8WV16 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF4Q8WV16 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF4Q8WV16 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF4Q8WV16 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF4Q8WV16 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF4Q8WV16 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF4Q8WV16 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF4Q8WV16 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF4Q8WV16 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF4Q8WV16 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF4Q8WV16 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF4Q8WV16 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF4Q8WV16 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF4Q8WV16 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF4Q8WV16 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF4Q8WV16 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF4Q8WV16 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF4Q8WV16 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF4Q8WV16 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF4Q8WV16 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF4Q8WV16 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF4Q8WV16 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF4Q8WV16 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF4Q8WV16 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF4Q8WV16 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF4Q8WV16 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF4Q8WV16 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF4Q8WV16 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF4Q8WV16 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF4Q8WV16 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF4Q8WV16 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF4Q8WV16 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF4Q8WV16 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF4Q8WV16 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF4Q8WV16 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF4Q8WV16 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF4Q8WV16 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms