Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SLF2Q8IX21 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLF2Q8IX21 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLF2Q8IX21 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLF2Q8IX21 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLF2Q8IX21 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLF2Q8IX21 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLF2Q8IX21 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLF2Q8IX21 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLF2Q8IX21 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLF2Q8IX21 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLF2Q8IX21 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLF2Q8IX21 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLF2Q8IX21 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLF2Q8IX21 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLF2Q8IX21 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLF2Q8IX21 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLF2Q8IX21 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLF2Q8IX21 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLF2Q8IX21 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLF2Q8IX21 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLF2Q8IX21 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLF2Q8IX21 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLF2Q8IX21 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLF2Q8IX21 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLF2Q8IX21 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLF2Q8IX21 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLF2Q8IX21 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLF2Q8IX21 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLF2Q8IX21 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLF2Q8IX21 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLF2Q8IX21 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SLF2Q8IX21 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLF2Q8IX21 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SLF2Q8IX21 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLF2Q8IX21 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLF2Q8IX21 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLF2Q8IX21 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLF2Q8IX21 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLF2Q8IX21 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SLF2Q8IX21 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLF2Q8IX21 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLF2Q8IX21 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLF2Q8IX21 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLF2Q8IX21 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLF2Q8IX21 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLF2Q8IX21 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SLF2Q8IX21 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLF2Q8IX21 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLF2Q8IX21 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLF2Q8IX21 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLF2Q8IX21 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SLF2Q8IX21 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLF2Q8IX21 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLF2Q8IX21 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLF2Q8IX21 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SLF2Q8IX21 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLF2Q8IX21 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLF2Q8IX21 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLF2Q8IX21 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLF2Q8IX21 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLF2Q8IX21 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLF2Q8IX21 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLF2Q8IX21 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLF2Q8IX21 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLF2Q8IX21 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLF2Q8IX21 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLF2Q8IX21 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLF2Q8IX21 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLF2Q8IX21 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLF2Q8IX21 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLF2Q8IX21 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLF2Q8IX21 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLF2Q8IX21 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLF2Q8IX21 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLF2Q8IX21 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLF2Q8IX21 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLF2Q8IX21 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLF2Q8IX21 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLF2Q8IX21 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLF2Q8IX21 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLF2Q8IX21 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLF2Q8IX21 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLF2Q8IX21 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLF2Q8IX21 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLF2Q8IX21 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLF2Q8IX21 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLF2Q8IX21 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLF2Q8IX21 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLF2Q8IX21 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLF2Q8IX21 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLF2Q8IX21 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLF2Q8IX21 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SLF2Q8IX21 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLF2Q8IX21 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLF2Q8IX21 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLF2Q8IX21 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLF2Q8IX21 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLF2Q8IX21 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLF2Q8IX21 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms